Η δράση του μουσείου στηρίζεται σε τρεις προγραμματικούς κατευθυντήριους άξονες
- Ιστορία και Παράδοση : Το μουσείο προσφέρει μια μοναδική αναδρομή στο παρελθόν, ακολουθώντας και καταγράφοντας βήμα – βήμα την πορεία καλλιέργειας, επεξεργασίας και παραγωγής ντομάτας. Ο επισκέπτης περιηγείται στην ατμόσφαιρα μιας άλλης εποχής, έρχεται σε επαφή με τις παραδοσιακές μεθόδους που ακολουθούσαν οι ντοματοποιοί της Σαντορίνης, γνωρίζει με ειδικά προγράμματα την γαστρονομία και την αγροτική καλλιέργεια και ταυτόχρονα εμβαθύνει στην ιστορία του τόπου, των κατοίκων, των συνθηκών ζωής, των ασχολιών και των παραδόσεων της.
- Πολιτισμός: αναπόσπασπαστο και καίριο κομμάτι του Βιομηχανικού Μουσείου Τομάτας, το Εργοστάσιο Τεχνών Σαντορίνης είναι ένας μη- κερδοσκοπικός οργανισμός για την προώθηση της ελληνικής πολιτιστικής παράδοσης σε ένα διεθνές ακροατήριο. Συμπεριλαμβάνονται: παραγωγές μουσικής, θεάτρου, χορού, γλυπτικής, video art και εικαστικές εγκαταστάσεις, συνθέτουν ένα ιδιαίτερο πολιτιστικό τοπίο, εμπνευσμένο από το σύγχρονο κόσμο και τα σπουδαιότερα καλλιτεχνικά ρεύματα.
- Εκπαίδευση: η προσπάθεια μας να εμπλουτίζουμε και να ανανεώνουμε συνεχώς τις δράσεις του χώρου μας, μας οδήγησε στη δημιουργία κύκλων εργαστηρίων για μικρούς και μεγάλους. Με αυτόν τον τρόπο τα παιδιά έρχονται σε επαφή με τη δημιουργικής τους πλευράς με έναν προσαρμοσμένο στις ανάγκες τους τρόπο, με βασικό άξονα τη βιωματική εμπειρία. Μέσα από τις συναντήσεις, οι «μαθητές» μας έχουν την ευκαιρία να τροφοδοτήσουν και να εξελίξουν τη φαντασία τους, να εμπλουτίσουν το λεξιλόγιο τους, να ενισχύσουν την αφηγηματική τους ικανότητα και την έκφρασή τους, να ενδυναμώσουν σημαντικά τη συγκέντρωση και την μνήμη τους, να ευαισθητοποιηθούν για την παράδοση και να ενισχύσουν την αυτοπεποίθησή τους.